伴随着高通量测序和宏基因组学技术的快速发展,细菌生命之树的多样性得到了极大的扩展,这更加确立了细菌在生态学和进化领域的重要地位。然而,由于缺乏基因组信息,以往的研究对于稀有生物圈(相对丰度小于生物总量的0.1%)中的细菌群落在生态系统中发挥的功能还鲜有报道。
近日,深圳大学高等研究院李猛课题组在Science China Life Sciences发表了题为Genomic insights into versatile lifestyle of three new bacterial candidate phyla的研究论文,发现并揭示了3种稀有的细菌门类的代谢特征与进化历史。
该论文结合宏基因组学、生物信息学和进化生物学等分析技术,深入探讨了3种新的细菌门类的全球生态分布特征、生理代谢多样性特征及其进化历史,并以中国神话人物中的3个海龙王的形象分别将其命名为青龙细菌门(Qinglongiota),黑龙细菌门(Heilongiota)和苍龙细菌门(Canglongiota)。这3类细菌一般生活在厌氧沉积物中或附着在颗粒有机物上,相对丰度较低(<0.1%),可以通过厌氧发酵或厌氧呼吸过程从糖类、蛋白质和短链脂肪酸中获取生长所需的能量。本研究进一步拓展了我们对细菌生命之树的认知。
图1:三个细菌候选新门的关键潜在代谢通路
深圳大学高等研究院张新旭副研究员和刘宗保副研究员为该文章的共同第一作者,李猛教授为通讯作者,深圳大学高等研究院为第一完成单位。该研究得到国家自然科学基金委、广东省教育厅和深圳市科创委等项目支持。
原文链接:http://engine.scichina.com/doi/10.1007/s11427-021-2037-x